Le CUCDB est associé statutairement à l’UCLy depuis sa création en 1993. Le Recteur de l’UCLy est vice-président de droit du CA du CUCDB. Le département de théologie du CUCDB fait partie de la faculté de théologie de l’UCLy pour la reconnaissance des formations dispensées. Les masters relatifs aux métiers de l’enseignement, de la formation et de l’éducation sont portés par l’UCLy ; les jurys rectoraux de ces masters d’Etat (validés par le Rectorat de Lyon) sont réunis au CUCDB.
Des enseignants-chercheurs de l’UCLy interviennent régulièrement dans la recherche et dans les formations de l’IFER (sessions nationales du master
“sciences de l’éducation et de l’enseignement du fait religieux”).